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我国学者提出新种子植物DNA条形码
2011/12/20 9:08:23

    在中科院大科学装置开放研究项目“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”的支持下,中国植物条形码研究团队在种子植物DNA条形码研究上取得重要进展,有关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》上。   

    据该团队成员、中科院昆明植物所副研究员高连明介绍,DNA条形码是利用标准基因片段对物种进行快速和准确鉴定的新技术。线粒体细胞色素C氧化酶基因CO1已成为较理想的动物DNA条形码。但由于植物线粒体基因进化速率较慢,筛选有效的植物DNA条形码已成为“国际生命条形码计划”的首要研究任务之一。

    为此,从2009年以来,中科院昆明植物研究所研究员李德铢联合全国19个科研院所和高校,组成了中国植物条形码研究团队。他们对主要来自中国的种子植物75科141属1757种共约6286个样本进行综合分析,发现三个质体DNA候选条形码片段具有较高通用性;核糖体核DNA候选条形码ITS在被子植物中的通用性较高,而在裸子植物中稍低。

    同时,他们还发现:ITS具有最高的物种分辨率,与三个质体DNA条形码片段的任何一个组合均可分辨69.9%~79.1%的物种。ITS的部分序列ITS2也表现出较高的物种分辨率。

    因此,研究团队建议将ITS作为种子植物的核心DNA条形码,同时强调了利用多个样本取样和不同遗传方式的DNA片段开展植物DNA条形码研究的重要性。

    国际生命条形码联盟植物工作组主席Pete Hollingsworth认为,该论文的发表,标志着在将DNA序列数据纳入植物物种水平分类和鉴定常规应用方面迈出了重要一步。

 

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